В новейшей истории Вавиловского университета международное сотрудничество ведет свой отсчет с момента образования в 1998 году объединенного Аграрного университета. В 2003 году Управление международных связей, преобразованное в 2016 году в Институт международных образовательных программ, на сегодняшний день это - Институт международных связей.

За пятнадцатилетний период становления международного сотрудничества в университете была создана эффективно функционирующая система интеграции в мировое научно-образовательное пространство. 

Вавиловский университет активно работал по привлечению передового зарубежного опыта для развития АПК Саратовской области. Проект «Создание системы информационно-консультационного обслуживания фермеров в Саратовской области» (2003-2005гг.) стал третьим проектом международного фонда «Евразия», реализованным и направленным на построение в Саратовской области полномасштабной инфраструктуры информационно-консультационной службы.

Реализацию получили множество международных проектов двустороннего сотрудничества. В университете была создана система академической мобильности студентов, преподавателей и сотрудников, позволившая повысить свою квалификацию и получить международный опыт более тысячи преподавателей и студентов вуза.

Следуя тенденции развития экспорта образования, в 2009 году в университете создано подготовительное отделение для иностранных граждан, позволившее университету в 2017 году войти в консорциум ведущих университетов страны по экспорту образования. За эти годы граждане более 40 стран прошли обучение в университете. В 2016 году Вавиловский университет первый среди аграрных вузов России начал реализацию программ на английском языке.

На сегодняшний день университет имеет широкую сеть международных партнеров, являющуюся основой развития международного научно-образовательного сотрудничества.