Особое место в экспозиции музея истории нашего университета занимает Великая Отечественная война. В годы ВОВ многие преподаватели, студенты и сотрудники институтов, на базе которых был образован наш университет, ушли на фронт защищать Родину. В корпусах институтов в годы войны располагались эвакогоспитали, а в корпусе зоотехническо-ветеринарного института находился штаб партизанского движения Украины.
В экспозиции можно увидеть заявления, которые писали студенты с просьбой принять их в ряды Красной Армии, фотографии участников войны, атрибуты экипировки и походной утвари солдат.
В годы ВОВ в СХИ силами преподавателей и студентов проводилась большая работа по выращиванию в учхозах института овощей и картофеля для снабжения воинских частей. В учебно-производственных мастерских СИМСХа был организован ремонт тягачей и тракторов для воинских частей, в межвузовской лаборатории ученые института проводили испытания и доработку боеприпасов, изготовляемых на саратовских предприятиях. Многие студенты, сотрудники и преподаватели Вавиловского университета принимали участие в строительстве оборонительных сооружений, вступали в ряды бойцов противовоздушной обороны, так как город, находясь недалеко от Сталинграда, в 1942 – 1943 гг. подвергался систематическим бомбардировкам авиации противника.
В экспозиции представлены материалы студентов, сотрудников и преподавателей университета – участников ВОВ. Сотрудниками музея постоянно ведется сбор материалов о ветеранах ВОВ. Попыткой обобщить собранный материал стала изданная в 2010 г. Книга Славы, в которой содержатся материалы о 15 Героях Советского Союза, более 190 участников ВОВ - сотрудников, студентов и преподавателей Вавиловского унивесритета.
В нашем ВУЗе существует поисковый отряд «Вега». Бойцы отряда проводят раскопки в местах сражений ВОВ, находят останки павших воинов и в торжественной обстановке предают их захоронению. Информацию о том, как это происходит, можно получить по фото, представленным в экспозиции. Попутно бойцы отряда «Вега» находят предметы экипировки бойцов Красной Армии, некоторые из которых представлены в экспозиции. Среди них – знаменитая винтовка Мосина, образца 1891/1930 г., с которой русские солдаты воевали еще в русско-японскую войну 1904 – 1905 годов, Первую мировую, Гражданскую и Великую Отечественную войны.
Материалы о Героях Советского Союза – сотрудниках, преподавателях и студентах Вавиловского университета представлены в экспозиции музея. Среди них – В.Н. Захаров, студент зоотехническо-ветеринарного института, посмертно удостоенный звания Героя, в экспозиции можно увидеть муляж Золотой звезды и грамоты Героя Советского Союза. Среди Героев на фотографии можно видеть Раису Ермолаевну Аронову, которая служила в женском авиаполку и именно она написала книгу «Ночные ведьмы», по которой в последствие был снят известный одноименный фильм.
В музее также находятся материалы, рассказывающие о ветеранах Великой Отечественной войны – сотрудниках и преподавателях Вавиловского университета, которые принимали участие в битве за Сталинград и обороне Ленинграда.
