Кафедра "Проектный менеджмент и внешнеэкономическая деятельность в АПК" является одной из ведущих выпускающих кафедр института. Свою историю кафедра начинает с 1931 года, когда на базе ветеринарного института была создана кафедра «Организация сельскохозяйственных предприятий», первым руководителем которой был Б.М. Худзик (1931-1933 гг). В дальнейшем заведовали кафедрой доценты: А.В. Фоусек (1933-1938 гг), В.С. Самойлов (1938-1941, 1946, 1961 гг.), В.А. Степанов (1972-1973 гг.), И.Е. Заика (1973-1976 гг.), В.Г. Кололеева (1976-1983 гг.), В.Г. Коновалов (1983-1987 гг.), Н.Г. Артеменко (1987-1992 гг.), профессор А.В. Красавкин (1992-1994 гг.), профессор М.С. Гавриков (1994-2000 гг.), доцент Ю.Н. Шишкина (2000-2003 гг.). С 2003 по 2022 г. заведующим кафедрой являлся д.э.н., профессор Воротников И.Л. С 2022 года кафедрой руководит профессор, д.э.н. Колотырин К.П.
До 1941 г. на кафедре преподавалась одна дисциплина: «Организация сельскохозяйственных предприятий». С изменением учебных планов подготовки кадров с 1946 года были введены «Экономика сельского хозяйства», «Статистика и бухгалтерский учет в сельском хозяйстве», а в 1970 г. - «Вычислительная техника и экономико-математические методы в инженерных расчетах». Углубление и совершентствование учебно-методической и научной работы сотрудников в 1977 г. привело к разделению коллектива на две самостоятельные кафедры: «Экономика сельского хозяйства» и «Организация и управление сельскохозяйственным производством». После объединения трех сельскохозяйственных вузов в Саратовский государственный аграрный университет им. Н.И. Вавилова в 1998 г. кафедры были объединены и в августе 1999 г. создана кафедра «Экономика и организация предприятий АПК». В 2013 году кафедра получила новое название «Инновационная деятельность и управление бизнесом". В 2015 г. после объединения с кафедрой "Организация производства и предпринимательство на предприятиях АПК" название изменилось на "Организация производства и управление бизнесом в АПК". В 2017 году произошло присоединение кафедры "Товароведение и менеджмент качества", при этом название кафедры осталось прежним. В 2019 году после объединения с кафедрой "Менеджмент и внешнеэкономическая деятельность" кафедра "Организация производства и управление бизнесом в АПК" стала называться "Проектный менеджмент и внешнеэкономическая деятельность в АПК"
